PubMed Central

PubMed Central
Producent Verenigde Staten Nationale Bibliotheek van geneeskunde (Verenigde Staten)
Geschiedenis 2000 tot heden
Toegang
Kosten Vrij
Dekking
Disciplines Geneesmiddel
Record diepte Index, abstract en volledige tekst
Formaatdekking nieuws artikelen
Links
Website WWW.ncbi.nlm.NIH.gov/PMC/
Titellijst (s) WWW.ncbi.nlm.NIH.gov/PMC/Journals/

PubMed Central (PMC) is een gratis digitale repository die archieven vrije toegang full-text wetenschappelijke artikelen die zijn gepubliceerd in biomedisch en levenswetenschappen tijdschriften. Als een van de belangrijkste onderzoeksdatabases ontwikkeld door de Nationaal centrum voor biotechnologie -informatie (NCBI), PubMed Central is meer dan een documentrepository. Inzendingen bij PMC worden geïndexeerd en opgemaakt voor verbeterde metadata, medisch ontologieen unieke identificatiegegevens die de XML gestructureerde gegevens voor elk artikel.[1] Inhoud binnen PMC kan worden gekoppeld aan andere NCBI -databases en toegankelijk via Entree Zoeken- en ophaalsystemen, waardoor het vermogen van het publiek om de biomedische kennis ervan te ontdekken, te lezen en voort te bouwen verder te verbeteren.[2]

PubMed Central is onderscheiden van PubMed.[3] PubMed Central is een gratis digitaal archief van volledige artikelen, toegankelijk voor iedereen van overal via een webbrowser (met verschillende bepalingen voor hergebruik). Omgekeerd, hoewel PubMed een doorzoekbare database is van biomedische citaten en samenvattingen, bevindt het artikel met volledige tekst zich elders (in print of online, gratis of achter een abonnee betaalwand).

Vanaf december 2018, het PMC -archief bevatte meer dan 5,2 miljoen artikelen,[4] met bijdragen afkomstig van uitgevers of auteurs die hun manuscripten in de repository storten volgens de NIH Public Access -beleid. Eerdere gegevens tonen aan dat van januari 2013 tot januari 2014 de door auteur geïniteerde deposito's gedurende een periode van 12 maanden 103.000 artikelen overschreden.[5] PMC identificeert ongeveer 4.000 tijdschriften die deelnemen aan een capaciteit om hun gepubliceerde inhoud in de PMC -repository te storten.[6] Sommige uitgevers stellen de release van hun artikelen op PubMed Central voor een vaste tijd na publicatie uit, aangeduid als een "embargo -periode", variërend van enkele maanden tot enkele jaren, afhankelijk van het tijdschrift. (Embargo's van zes tot twaalf maanden zijn de meest voorkomende.) PubMed Central is een belangrijk voorbeeld van "systematische externe verdeling door een derde partij",[7] die nog steeds verboden is door de bijdrage -overeenkomsten van veel uitgevers.

Adoptie

Zie ook: NIH Public Access -beleid

De repository is gelanceerd in februari 2000 en is snel gegroeid als de NIH Public Access -beleid is ontworpen om al het onderzoek te maken dat wordt gefinancierd door de National Institutes of Health (NIH) vrijelijk toegankelijk voor iedereen, en bovendien werken veel uitgevers samen met de NIH om gratis toegang tot hun werken te bieden. Eind 2007 werd de Consolidated Appropriations Act van 2008 (H.R. 2764) ondertekend in de wet en omvatte een bepaling die de NIH verplicht om het beleid te wijzigen en opname te vereisen in PubMed Central Complete Electronic kopieën van hun peer-reviewed onderzoek en bevindingen van NIH-gefinancierde Onderzoek. Deze artikelen moeten binnen 12 maanden na publicatie worden opgenomen. Dit is de eerste keer dat de Amerikaanse regering een bureau verplicht heeft te voorzien vrije toegang Onderzoek en is een evolutie van het beleid van 2005, waarin de NIH onderzoekers vroeg om vrijwillig hun onderzoek toe te voegen aan PubMed Central.[8]

Een Britse versie van het PubMed Central System, UK PubMed Central (UKPMC), is ontwikkeld door de Wellcome Trust en de Britse bibliotheek Als onderdeel van een negen-koppige groep Britse onderzoeksfinanciers. Dit systeem ging live in januari 2007. Op 1 november 2012 werd het Europa PubMed Central. Het Canadese lid van het PubMed Central International Network, PubMed Central Canada, werd gelanceerd in oktober 2009.

De Nationale bibliotheek van geneeskunde "NLM Journal Publishing Tag Set" Journal -artikel markup -taal is vrij beschikbaar.[9] De Vereniging van geleerde en professionele samenleving uitgevers Opmerkingen dat "het waarschijnlijk de standaard wordt voor het voorbereiden van wetenschappelijke inhoud voor zowel boeken als tijdschriften".[10] A gerelateerd DTD is beschikbaar voor boeken.[11] De Library of Congress En de British Library heeft steun aangekondigd voor de NLM DTD.[12] Het is ook populair geweest bij journal -serviceproviders.[13]

Met de release van openbare toegangsplannen voor veel agentschappen buiten NIH, is PMC bezig met het worden van de repository voor een grotere verscheidenheid aan artikelen.[14] Dit omvat NASA -inhoud, waarbij de interfacemerk als "pubspace" is gebrandmerkt.[15][16]

Technologie

Artikelen worden door uitgevers naar PubMed Central gestuurd XML of SGML, met behulp van een verscheidenheid aan artikel DTD's. Oudere en grotere uitgevers hebben misschien hun eigen gevestigde interne DTD's, maar veel uitgevers gebruiken de NLM Journal Publishing DTD (zie hierboven).

Ontvangen artikelen worden omgezet via Xslt met de zeer vergelijkbare NLM -archivering en uitwisseling DTD. Dit proces kan fouten onthullen die worden gerapporteerd aan de uitgever voor correctie. Graphics worden ook omgezet in standaardindelingen en maten. De originele en geconverteerde vormen worden gearchiveerd. De geconverteerde vorm wordt verplaatst naar een relationele database, samen met bijbehorende bestanden voor afbeeldingen, multimedia of andere bijbehorende gegevens. Veel uitgevers bieden ook PDF van hun artikelen, en deze worden zonder verandering beschikbaar gesteld.[17]

Bibliografische citaten worden ontleed en automatisch gekoppeld aan de relevante samenvattingen in PubMed, artikelen in PubMed Central en bronnen op websites van uitgevers. PubMed Links leiden ook naar PubMed Central. Niet -oplosbare referenties, zoals tijdschriften of bepaalde artikelen die nog niet beschikbaar zijn in een van deze bronnen, worden gevolgd in de database en komen automatisch "live" wanneer de bronnen beschikbaar komen.

Een intern indexeringssysteem biedt zoekmogelijkheden en is zich bewust van biologische en medische terminologie, zoals Generic Vs. gepatenteerd medicijn namen en alternatieve namen voor organismen, ziekten en anatomische delen.

Wanneer een gebruiker toegang heeft tot een journaalprobleem, wordt een inhoudsopgave automatisch gegenereerd door alle artikelen, brieven, redactionele artikelen, enz. Op te halen voor dat probleem. Wanneer een daadwerkelijk item zoals een artikel is bereikt, converteert PubMed Central de NLM -marker HTML voor levering en biedt links naar gerelateerde gegevensobjecten. Dit is mogelijk omdat de verscheidenheid aan inkomende gegevens eerst is omgezet in standaard DTD's en grafische formaten.

In een afzonderlijke inzendingstroom kunnen door NIH gefinancierde auteurs artikelen in PubMed Central storten met behulp van de NIH Manuscript Submission (NIHMS). Aldus ingediende artikelen gaan doorgaans door XML -opmaak om te worden geconverteerd naar NLM DTD.

Ontvangst

Reacties op PubMed Central onder de wetenschappelijke publicatiegemeenschapsbereik tussen een echt enthousiasme door sommigen,[18] voor voorzichtige bezorgdheid door anderen.[19]

Hoewel PMC een welkome partner is voor open toegangsuitgevers in het vermogen om de ontdekking en verspreiding van biomedische kennis te vergroten, zorgt diezelfde waarheid ervoor dat anderen zich zorgen maken dat het verkeer wordt afgeleid van de gepubliceerde Versie van record, de economische gevolgen van minder lezers, evenals het effect op het onderhouden van een gemeenschap van wetenschappers in geleerde samenlevingen.[20][21] Een analyse uit 2013 vond sterk bewijs dat openbare repositories van gepubliceerde artikelen verantwoordelijk waren voor "een aanzienlijk aantal lezers weghalen van tijdschriftwebsites" en dat "het effect van PMC in de loop van de tijd groeit".[22]

Bibliotheken, universiteiten, open toegangsondersteuners, belangenorganisaties voor consumentengezondheid en organisaties voor patiëntenrechten hebben PubMed Central toegejuicht en hopen dat vergelijkbare repositories voor openbare toegang zijn ontwikkeld door andere federale financieringsinstanties om vrijelijk onderzoekspublicaties te delen die het gevolg waren van belastingbetalerondersteuning .[23]

Uit de Antelman Study of Open Access Publishing bleek dat in filosofie, politieke wetenschappen, elektrische en elektronische engineering en wiskunde, vrije toegang Papers hadden een grotere onderzoekseffect.[24] Een gerandomiseerde studie vond een toename van inhoudsdownloads van open toegangspapers, zonder een citaatvoordeel ten opzichte van abonnementstoegang een jaar na publicatie.[25]

Het NIH -beleid en de open toegangsrepository werk hebben een Presidentiële richtlijn 2013 die ook in andere federale agentschappen heeft geleid tot actie.

In maart 2020 versnelde PubMed Central zijn stortingsprocedures voor de volledige tekst van publicaties op coronavirus. De NLM deed dit op verzoek van het Witte Huis Office of Science and Technology Policy en internationale wetenschappers om de toegang voor wetenschappers, zorgverleners te verbeteren, Data Mining Innovators, AI -onderzoekers in de gezondheidszorg, en het grote publiek.[26]

PMCID

De PMCID (PubMed Central ID), ook bekend als het PMC -referentienummer, is een bibliografisch identificatier voor de PubMed Central Open Access -database, net als de Pmid is de bibliografische identificatie voor de PubMed Database. De twee identificatiegegevens zijn echter verschillend. Het bestaat uit "PMC" gevolgd door een snaar van zeven nummers. Het formaat is:[27]

  • PMCID: PMC1852221

Auteurs solliciteren naar NIH Awards moeten de PMCID in hun aanvraag opnemen.

Zie ook

Referenties

  1. ^ Beck J (2010). "Rapport van het veld: PubMed Central, een XML-gebaseerd archief van Life Sciences Journal-artikelen". Proceedings of the International Symposium on XML voor de lange termijn: kwesties in de langetermijnbehoud van XML. 6. doen:10.4242/balisagevol6.beck01. ISBN 978-1-935958-02-4.
  2. ^ Maloney C, Sequeira E, Kelly C, Orris R, Beck J (5 december 2013). PubMed Central. National Center for Biotechnology Information (VS).
  3. ^ "Medline, PubMed en PMC (PubMed Central): hoe zijn ze verschillend?". www.nlm.nih.gov. 9 september 2019.
  4. ^ "Standaard openheid", Inside hoger ed, 16 januari 2017.
  5. ^ "NIHMS -statistieken". nihms.nih.gov.
  6. ^ "Home - PMC - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov.
  7. ^ Ouerfelli N. "Auteurrechten: waar gaat het allemaal over" (PDF).
  8. ^ "Publieke toegang tot NIH -onderzoek heeft recht gemaakt". Science Codex. 2007. Gearchiveerd van het origineel Op 4 maart 2016. Opgehaald 6 november 2013.
  9. ^ "Journal Publishing Tag Set". Nationaal centrum voor biotechnologie -informatie. Opgehaald 6 november 2013.
  10. ^ French D (4 augustus 2006). "ALPSP Technology Update: een standaard XML -documentformaat: de case voor de goedkeuring van NLM DTD". Alpensp. Opgehaald 6 november 2013.
  11. ^ "NCBI Book Tag Set". dtd.nlm.nih.gov.
  12. ^ "Nieuws uit de Library of Congress". Library of Congress. 19 april 2006. Opgehaald 6 november 2013.
  13. ^ "Inera Inc. - NLM DTD -bronnen". 19 februari 2013. Gearchiveerd van het origineel op 2013-02-19.
  14. ^ "Publieke toegangsplannen van Amerikaanse federale agentschappen". cendi.gov. Gearchiveerd van het origineel op 2020-10-18. Opgehaald 2016-08-19.
  15. ^ Kovo Y (22 juli 2016). "Publieke toegang tot resultaten van door NASA gefinancierd onderzoek". nasa.gov. Gearchiveerd van het origineel op 19 augustus 2016.
  16. ^ "NASA in PMC". preview.ncbi.nlm.nih.gov.
  17. ^ NLM Journal Archiving and Interchange Tag Suite, National Center for Biotechnical Information, National Library of Medicine
  18. ^ "PLOS juicht het Congres toe voor actie op open toegang". Gearchiveerd van het origineel op 2016-05-07. Opgehaald 2014-02-07.
  19. ^ "ACS-indiening bij het Office of Science and Technology Policy-verzoek om informatie over openbare toegang tot peer-reviewed wetenschappelijke publicaties als gevolg van federaal gefinancierd onderzoek" (PDF). Office of Science and Technology Policy. Opgehaald 2014-02-07 - via Nationale archieven.
  20. ^ Davis PM (oktober 2012). "Het effect van openbare storting van wetenschappelijke artikelen op lezers". De fysioloog. 55 (5): 161, 163–5. Pmid 23155924.
  21. ^ Davis PM (juli 2013). "Publieke toegankelijkheid van biomedische artikelen van PubMed Central vermindert tijdschrift lezership-retrospectieve cohortanalyse". FASEB Journal. 27 (7): 2536–41. doen:10.1096/fj.13-229922. PMC 3688741. Pmid 23554455.
  22. ^ Davis PM (juli 2013). "Publieke toegankelijkheid van biomedische artikelen van PubMed Central vermindert tijdschrift lezership-retrospectieve cohortanalyse". FASEB Journal. 27 (7): 2536–41. doen:10.1096/fj.13-229922. PMC 3688741. Pmid 23554455.
  23. ^ "Autism Speaks kondigt een nieuw beleid aan om gezinnen gemakkelijk te geven, gratis toegang tot belangrijke onderzoeksresultaten - persbericht - Autisme spreekt". www.autismspeaks.org. 25 juli 2012.
  24. ^ Antelman, Kristin (2004). "Hebben artikelen met open toegang een grotere onderzoekseffect?". College & Research Libraries. 65 (5): 372–382. doen:10.5860/crl.65.5.372., samengevat door Stamper J, Williams K (2006). "Wetenschappelijke communicatie: crisis omzetten in kansen". Nieuws van College & Research Libraries. 67 (11): 692–696. doen:10.5860/crln.67.11.7720.
  25. ^ Davis PM, Lewenstein BV, Simon DH, Booth JG, Connolly MJ (juli 2008). "Open Access Publishing, artikel downloads en citaten: gerandomiseerde gecontroleerde proef". BMJ. 337: A568. doen:10.1136/bmj.a568. PMC 2492576. Pmid 18669565.
  26. ^ "De National Library of Medicine breidt de toegang tot coronavirusliteratuur uit via PubMed Central". National Institutes of Health (NIH). 2020-03-25. Opgehaald 2020-03-31. Om dit initiatief te ondersteunen, past NLM zijn standaardprocedures aan voor het afzetten van artikelen in PMC om een grotere flexibiliteit te bieden die ervoor zorgt dat coronavirusonderzoek direct beschikbaar is.
  27. ^ "Neem PMCID op in citaten | publicAccess.nih.gov". publicaccess.nih.gov. Opgehaald 2017-07-01.

Externe links


[[Categorie: Open-AC Cess Archives]]