Eran Elhaik

Eran Elhaik
Geboren 1980 (leeftijd 41–42)
Nationaliteit Israëlisch en Amerikaans
Alma mater Universiteit van Houston
Wetenschappelijke carrière
Velden Genetica, bio -informatica, Bevolkingsgenetica
Instellingen Johns Hopkins University, Universiteit van Sheffield, Lund University
Doctoraatsadviseur Dan Graur
Website WWW.eranelhaiklab.org

Eran Elhaik (geboren 1980) is een Israëlisch-Amerikaans geneticus en bio -informatieman, en een universitair hoofddocent bioinformatica bij Lund University in Zweden.Zijn onderzoek gebruikt rekenkundig, statistisch, epidemiologisch en wiskundig benaderingen van velden zoals complexe aandoeningen, bevolkingsgenetica, Gepersonaliseerd medicijn, moleculaire evolutie, genomica, paleogenomics en epigenetica.

Carrière

Na het voltooien van niet -gegradueerde studies in Israël, verkreeg hij een Promotie in moleculaire evolutie Onder toezicht van Dan Graur bij de Universiteit van Houston in 2009, gevolgd door postdoctoraal onderzoeksbeurzen aan de Johns Hopkins University School of Medicine and School of Public Health.In 2011 de Genografisch project, nadat de bezorgdheid is ontstaan over het behoud van particuliere genetische gegevens van individuen in onderzochte populaties, Elhaik inhuurde en hem vroeg om een methode te ontwerpen die analisten in staat zou stellen alleen historische informatie te extraheren uit het verzamelende genomische bewijs van populaties op zodanig datHoud hun particuliere gezondheidsprofiel verzameld bij personen, zonder inbreuk te maken op hun persoonlijke gezondheidsgegevens privé. ' [1] Van 2014 tot 2019 werkte hij bij de Universiteit van Sheffield Afdeling Animal and Plant Sciences in het Verenigd Koninkrijk.[2] Sinds 2019 is hij universitair hoofddocent bioinformatica aan de afdeling Biologie bij Lund University in Zweden.[3][4]

Onderzoek

Op het gebied van moleculaire evolutie werkte Elhaik aan de compositorisch domein model dat de compositorische organisatie beschrijft van dier Genomen.[5]

Op het gebied van complexe aandoeningen stelde hij voor dat de Allostatische belasting Theorie kan worden gebruikt om uit te leggen bipolaire stoornis[6] en Wiegendood (SIDS).[7] Volgens deze theorie heeft de accumulatie van perinatale en prenatale stressoren neurotoxische effecten met gevolgen voor iemands gezondheid.

Op het gebied van genetica maakte Elhaik deel uit van het team dat de Genochip Microarray voor de Genografisch project en hun online tests.[8] Hij heeft ook bijgedragen aan de ontwikkeling van algoritmen voor data compressie.[9] In eerdere afkomststudies werden moderne vaderlijke of moederlijke haplogroepen gebruikt om migraties in de oudheid te traceren.Elhaik was verspreid over de methode en beschouwde deze problematisch 'omdat de moderne frequenties van haplogroepen het verleden niet zeer nauwkeurig vertegenwoordigen.'Daartoe ontwikkelde hij zijn AGPS -algoritme om plaats van herkomst met grotere precisie te vestigen.[10]

Op het gebied van bevolkingsgenetica heeft Elhaik artikelen gepubliceerd die de voorouders van Europese joden analyseren[11][12][13] en Druze,[14][15] inclusief werk gerelateerd aan de Khazar -hypothese van Ashkenazi -afkomst, een omstreden onderwerp dat media -aandacht heeft gekregen.[16] Elhaik pleit voor een nietLevantijns oorsprong van de Ashkenazi en begunstigt de hypothese dat ze van gemengde Irano-Turko-Slavische en Zuid-Europese afkomst zijn.[17] Het grootste deel van het genetische onderzoek van Elhaik maakt gebruik van het GPS (geografische populatiestructuur) algoritme dat door hem en co-auteurs is ontworpen.[18]

Elhaik zelf nam aanvankelijk contact op met Harry Ostrer, die, samen met de meeste andere wetenschappers in het veld, voorstelt dat de Joden genetisch gerelateerd en relatief homogeen zijn, om toestemming te krijgen voor toegang tot de door Ostrer en zijn collega's gebruikt om hun resultaat vast te stellen.Ostrer was bereid zijn gegevens te delen, op voorwaarde dat Elhaik een voorstel indient waaruit blijkt dat het project aan verschillende criteria voldeed, waaronder dat het "niet-definiërende aard is tegenover het Joodse volk", die Elhaik beschouwde als bewijs van vooringenomenheid en welke kinderarts Catherine DeAngelis 'bijzonder' genoemd.[19]

Elhaik heeft gezegd dat hoewel zijn paper "de aandacht heeft getrokken van anti-zionisten en 'antisemitische blanke supremacists' ', was het niet de bedoeling om een verband met bijbelse joden te weerleggen, maar eerder' om de racistische onderbouwing van antisemitisme te eliminerenin Europa".[19]

Op het gebied van paleogenetica heeft Elhaik artikelen gepubliceerd die informatieve markeringen voor oude afkomst (AAIMS) hebben geïdentificeerd, die kunnen worden gebruikt voor de biolocalisatie van oude individuen [20] Hij heeft ook een op AI gebaseerde methode ontwikkeld genaamd Temporal Population Structure (TPS) tot op heden zonder voorkennis van hun DNA uit hun DNA.[21]

In termen van pure theorie heeft Elhaik een kritiek gepubliceerd op de methodologie van PCA Dat ligt ten grondslag aan de hele structuur van populatiegenetica.Opnieuw analyseren van 12 PCA-toepassingen Hij ontdekte dat de methode zich leent voor het genereren van de gewenste resultaten, en wordt gekenmerkt door cherrimeren en cirkelredenering.De ontwerpflexibiliteit van PCA stelt iedereen in staat om vooropgezette claims over te maken etnogenese.Hij illustreerde het punt door het geval van genetische studies van de oorsprong van Ashkenazi Joden.[22]

Reacties

De nauwkeurigheid en betrouwbaarheid van Elhaik's populatiegenetische theorie van de Khazars ontmoette sterke kritiek van een aantal andere genetici,[23][24] evenals van taalkundigen die uitzondering namen op zijn gebruik van Paul Wexler's theorieën over het Jiddisch.[25]

In het bijzonder werd de geldigheid van de proxypopulatie die in zijn eerste Khazar -papier werd gebruikt, bekritiseerd op methodologische gronden.[26][27][28][29][30][31][32][33] Verschillende resultaten van wat iedereen heeft verkregen uit in wezen vergelijkbare gegevens ".[19] Elhaik is blijven werken in peer-reviewed tijdschriften die zijn onderzoek ondersteunen en ontwikkelen naar vragen over de afkomst van Joodse bevolkingsgroepen.[34] Elhaik's positie is dat dat Hoofdcomponentanalyse, gebruikt om populatiestructuren en hun afkomst te identificeren, heeft ernstige fouten die onjuiste resultaten opleveren.[35]

In een overzicht uit 2015 van de kwestie van pogingen om een inclusief genetisch profiel van alle Joden af te leiden, Raphael Falk, het aanraken van de bijdrage van Elhaik aan het argument in 2013, schreef:

De bevindingen ondersteunen de hypothese die stelt dat Europese Joden bestaan uit Kaukasus, Europese en Midden -Oosterse voorouders, en het Europese Joodse genoom afbeelden als een mozaïek van Kaukasus, Europese en Semitische voorouderingen, waardoor eerdere tegenstrijdige rapporten van Joodse voorouder worden geconsolideerd.

Falk merkte toen op dat het vervolgdocument van Behar de resultaten van Elhaik uitdaagde, betoogde dat de bevolking van de zuidelijke Kaukasus, bemonsterd door Elhaik, gerelateerd waren aan landen verder naar het zuiden.Het probleem, concludeerde hij, was dat 'het risico op circulariteit van het argument wordt blootgesteld: geneticus bepaalt de genotypische details van de classificaties van sociaal-etnologen, terwijl sociaal-demografen vertrouwen op genetische bevindingen om hun classificaties te versterken.'[36]

Referenties

  1. ^ Christine Kenneally, De onzichtbare geschiedenis van het menselijk ras: hoe DNA en geschiedenis onze identiteit en onze toekomst vormen, Penguin -boeken, 2014 ISBN978-0-698-17629-4: 'In 2011 werd Eran Elhaik ingehuurd om een van de grootste puzzels op te lossen in de geschiedenis van het menselijk ras.‘Het volgen van de mislukte Human Genome Diversity Project, National Geographic lanceerde de Genografisch project in 2005 om een manier te ontwikkelen om het Y -chromosoom van mensen en mttDNA te lezen).In 2011 besloot Genographic om alle chromosomen op te nemen en ook autosomaal DNA te analyseren.Elhaik werd gevraagd om een methode te ontwerpen die de meeste informatie uit een monster zou halen, maar tegelijkertijd alleen historische informatie zou extraheren en niet iets te maken met de gezondheid of kenmerken van een individu. '
  2. ^ "Dr. Eran Elhaik". Universiteit van Sheffield.
  3. ^ Eran Elhaik, Lund University
  4. ^ Eran Elhaik - Nieuwe senior docent
  5. ^ Elhaik, Eran;Graur, Dan;Josić, Krešimir;Landan, Giddy (2010). "Het identificeren van compositief homogene en niet -homogene domeinen in het menselijke genoom met behulp van een nieuw segmentatie -algoritme". Nucleïnezuren onderzoek. 38 (15): E158. doen:10.1093/nar/gkq532. PMC 2926622. Pmid 20571085.
  6. ^ Elhaik, Eran;Zandi, Peter (2015)."Dysregulatie van de NF-KB-route als een potentiële inductor van bipolaire stoornis". Journal of Psychiatric Research. 70: 18–27. doen:10.1016/j.jpsychires.2015.08.009. Pmid 26424419.
  7. ^ Elhaik, Eran (2016). "Een 'slijtage' -hypothese om het plotselinge doodssyndroom van baby te verklaren". Frontiers in Neurology. 7: 180. doen:10.3389/fneur.2016.00180. PMC 5083856. Pmid 27840622.
  8. ^ "Genome Biology and Evolution | Oxford Academic".
  9. ^ Chanda, P;Elhaik, E;Bader, JS (27 juli 2012). "Hapzipper: Hapmap -populaties delen is gewoon gemakkelijker geworden". Nucleïnezuren onderzoek. 40 (20): E159. doen:10.1093/nar/gks709. PMC 3488212. Pmid 22844100.
  10. ^ Gesprekken met Eran Elhaik: Oude migraties volgen Wetenschappelijk onderzoeker 6 juli 2017
  11. ^ Elhaik, E (1 januari 2013). "De ontbrekende schakel van Joodse Europese afkomst: contrasteren van het Rijnland en de Khazarian -hypothesen". Genoom Biologie en evolutie. 5 (1): 61–74. doen:10.1093/gbe/evs119. PMC 3595026. Pmid 23241444.
  12. ^ Das, R (19 april 2016). "Ashkenazic Joden lokaliseren naar oervieren in de oude Iraanse landen van Ashkenaz". Genoom Biologie en evolutie. 8 (7): 1132–49. doen:10.1093/gbe/evw046. PMC 4860683. Pmid 26941229.
  13. ^ Elhaik, E (5 augustus 2016). "Op zoek naar de Jüdische typus: Een voorgestelde benchmark om de genetische basis van joodsheid te testen, daagt noties van "Joodse biomarkers" uit". Frontiers in genetica. 7 (141): 141. doen:10.3389/fgene.2016.00141. PMC 4974603. Pmid 27547215.
  14. ^ Elhaik, E (1 januari 2013). "De ontbrekende schakel van Joodse Europese afkomst: contrasteren van het Rijnland en de Khazarian -hypothesen". Genoom Biologie en evolutie. 5 (1): 61–74. doen:10.1093/gbe/evs119. PMC 3595026. Pmid 23241444.
  15. ^ Marshall, S (16 november 2016). "Reconstructie van de Druzen -bevolkingsgeschiedenis". Wetenschappelijke rapporten. 6 (35837): 35837. Bibcode:2016natsr ... 635837m. doen:10.1038/SREP35837. PMC 5111078. Pmid 27848937.
  16. ^ Keys, David (20 april 2016). "Wetenschappers onthullen de vergeten Turkse wortels van de Joodse geschiedenis". De onafhankelijke.
  17. ^ Ranajit Das, Paul Wexler, Mehdi Pirooznia en Eran Elhaik,'De oorsprong van Ashkenaz, Ashkenazic Joden en Jiddisch',Frontiers in genetica 21 juni 2017
  18. ^ Elhaik, Eran;Tatarinova, Tatiana;Chebotarev, Dmitri;Piras, Ignazio S;Calò, Carla Maria;De Montis, Antonella;Atzori, Manuela;Marini, Monica;Tofanelli, Sergio;Francalacci, Paolo;Pagani, Luca;Tyler-Smith, Chris;Xue, Yali;Cucca, Francesco;Schurr, Theodore G.;Gaieski, Jill B.;Melendez, Carlalynne;Vilar, Miguel G.;Owings, Amanda C.;Gómez, Rocío;Fujita, Ricardo;Santos, Fabrício R.;Comas, David;Balanovsky, Oleg;Balanovska, Elena;Zalloua, Pierre;Soodyall, Himla;PitchAppan, Ramasamy;Ganeshprasad, Arunkumar;Hammer, Michael;Matisoo-Smith, Lisa;Wells, Spencer R.;The Genographic Consortium (2014). "Geografische populatiestructuuranalyse van wereldwijde menselijke populaties leidt tot hun biogeografische oorsprong". Natuurcommunicatie. 5: 3513. doen:10.1038/ncomms4513. PMC 4007635. Pmid 24781250.
  19. ^ a b c Rubin, Rita (7 mei 2013). "'Joden een ras' genetische theorie komt onder hevige aanval door DNA -expert ".
  20. ^ Umberto Esposito, Ranajit Das, Syakir Syed, Mehdi Pirooznia en Eran Elhaik, 'Oude voorouders informatieve markers voor het identificeren van de oude bevolkingsstructuur van de fijne schaal bij Euraziërs,' Genen (Basel) 9 december 2018 Vol.9 (12): 625
  21. ^ Sara Behnamian, Umberto Esposito, Grace Holland, Mehdi Pirooznia, Conrad Brimacombe, Eran Elhaik, 'Tijdelijke populatiestructuur, een genetische dateringsmethode voor oude Euraziatische genomen van de afgelopen 10.000 jaar', Cell Reports Methods, Vol.2, nummer 8, augustus 2022
  22. ^ Elhaik, Eran (2022)."Principal Component Analyses (PCA) -gebaseerde bevindingen in populatiegenetische studies zijn zeer bevooroordeeld en moeten opnieuw worden geëvalueerd". Wetenschappelijke rapporten. 12. 14683. doen:10.1038/S41598-022-14395-4.
  23. ^ Behar, Doron M.;Mespalu, Mait;Baran, Yael;Kopelman, NAAMA M. S;Yunusbayev, Bayazit;Gladstein, Ariella;Tzur, Shay;Sahakyan, Hovhannes;Bahmanimehr, Ardeshir;Yepiskoposyan, Levon;Tambets, Kristiina;Khusnutdinova, Elza K.;Kushiniarevich, Alena;Balanovsky, Oleg;Balanovsky, Elena;Kovacevic, Lejla;Marjanovic, Damir;Mihailov, Evelin;Kouvasti, Anastasia;Triantaphylldis, Costas;King, Roy J.;Semino, Ornella;Torroni, Antonio;Hammer, Michael F.;Metspalu, Ene;Skorecki, Karl;Rosset, Saharon;Halperin, Eran;Willems, Richard;Rosenberg, Noah A. (2013). "Geen bewijs van genoombrede gegevens van een Khazar-oorsprong voor de Ashkenazi-joden". Menselijke biologie. 85 (6): 859–900. doen:10.3378/027.085.0604. Pmid 25079123. S2CID 2173604.
  24. ^ Flegontov, Pavel;Kassian, Alexei;Thomas, Mark G.;Fedchenko, Valentina;Changmai, Piya;Starostin, George (2016). "Valballen van de benadering van de geografische populatiestructuur (GPS) toegepast op menselijke genetische geschiedenis: een case study van Ashkenazi -joden". Genoom Biologie en evolutie. 8 (7): 2259–2265. doen:10.1093/gbe/evw162. PMC 4987117. Pmid 27389685.
  25. ^ APTROOT, Marion (2016). "Jiddische taal en Ashkenazic Joden: een perspectief uit cultuur, taal en literatuur". Genoom Biologie en evolutie. 8 (6): 1948–1949. doen:10.1093/gbe/evw131. PMC 4943202. Pmid 27289098.
  26. ^ Thomas, Matthew (11 maart 2013). "DNA -voorouders test niet om te vertrouwen, zeggen experts". Bionews (nummer 696). Opgehaald 29 april 2021.
  27. ^ Thomas, Matthew (6 mei 2013). "Genetische afkomsttest beweert 'dorp te vinden waar uw DNA is gevormd'". Bionews (nummer 752). Opgehaald 29 april 2021.
  28. ^ Thomas, Matthew (12 mei 2014). "Zoveel genen, zo dicht bij huis". Bionews (nummer 753). Opgehaald 29 april 2021.
  29. ^ Kutzik, Jordan (28 april 2016). "Koop niet de junk science die zegt dat het Jiddisch is ontstaan in Turkije". De aanvaller. Opgehaald 29 april 2021.
  30. ^ Liphshiz, CNAAN (3 mei 2016). "Geleerden verwerpen theorie die Ashkenazi Joden naar Turkije traceren". Het Canadese Joodse nieuws. Opgehaald 29 april 2021.
  31. ^ Ostrer, Harry (11 september 2017). "Hoe 23andme viel voor antisemitische 'Khazar' canard". De aanvaller. Opgehaald 29 april 2021.
  32. ^ Beider, Alexander (25 september 2017). "Ashkenazi Joden zijn geen Khazars. Hier is het bewijs". De aanvaller. Opgehaald 29 april 2021.
  33. ^ Aram Yardumian, Theodore G Schurr, 'De geografie van Joodse etnogenese', ' Journal of Anthropological Research Deel 75, nummer 2 pp.206–234
  34. ^ Redactioneel: bevolkingsgenetica van wereldwijde Joodse mensen, Frontiers in genetica 28 juli 2017
  35. ^ Elhaik, Eran (2021). "Waarom de meeste hoofdcomponentanalyses (PCA) in populatiegenetische studies verkeerd zijn". doen:10.1101/2021.04.11.439381. S2CID 233246307. {{}}: Cite Journal vereist |journal= (helpen)
  36. ^ Raphael Falk 's 'Genetische markers kunnen geen Joodse afkomst bepalen,' Frontiers in genetica, 2014;5: 462, online 21 januari 2015

Externe links